回到南京，程慈航(乔振宇 饰)一次次想用真诚打动欧阳倩(安以轩 饰)，欧阳倩看到程慈航纠缠不休，违心地说方捷确实是自己男朋友。这个结果可以解释欧阳倩的反常，但这个最坏的结果让程慈航陷入绝望。

　　锦线还没来得及把假五九档案这个烫手山芋扔给哈金斯，中田派出的特工就盯上了齐掌柜的健康药店。从外面回来的李丽兰(王伟 饰)和齐掌柜发现有人在健康药店设伏之后，李丽兰为了保护更多的锦线弟子不受伤害，坚持要拿回锦线的秘密文件。经过一番激烈的搏斗，李丽兰和齐掌柜杀死敌人，匆忙中的李丽兰害怕文件有所遗漏，一把火烧了健康药店。

　　绝望的程慈航只好用查找五九档案来麻醉自己，他找莫采石(巫刚 饰)询问五九档案的消息。莫采石以长者的姿态劝程慈航，欧阳倩不值得他继续爱下去，霍蜜儿(郭晓婷 饰)才是他最合适的伴侣。这时，严达庆(王品一 饰)来报告锦线堂口发生凶杀案。程慈航决定利用首席大侦探的权力，把锦线弟子全部逮捕，以此达到保护锦线的目的。程慈航周身弥漫出来的煞气，让本已心情平静的莫采石心神惶恐不已。

　　李丽兰发现连警方都对锦线下手，她让齐掌柜离开南京找马太太告知情况，自己要找哈金斯，把这个烫手山芋扔给美国人。李丽兰以五九档案会给锦线带来祸端为由要把五九档案交给哈金斯，哈金斯以为捡了个大便宜，他答应李丽兰，自己会向中国政府发外交照会针对锦线问题提出抗议。哈金斯刚从中央储备银行取出铁匣子，就遭到不明身份人的袭击。程慈航认为歹徒一定是为五九档案而来，他要立即找哈金斯问个清楚。国际饭店，上当受骗的哈金斯在程慈航面前假装糊涂，他告诉程慈航，袭击自己的应该是锦线弟子，督促程慈航对锦线展开抓捕。哈金斯漏洞百出的话让程慈航不知道是否应该对付马太太。

　　话说包子店老板看到报纸上大肆报道五九档案的消息，这才想起老乞丐交给自己的铁匣子，他翻箱倒柜找到之后，和报纸上的图片一比较，确认就是在江湖上引起血雨腥风的五九档案，包子店老板欣喜万分。五九档案重现江湖，齐掌柜准备告诉马太太这一消息，筹钱购买。行色匆匆的齐掌柜遭到警察的追捕，欧阳倩及时把她救下，安排齐掌柜走相对安全的水路。

　　程慈航仔细回忆欧阳倩在处理锦线问题上的种种可疑之处，他决定赶往江流湾探明真相。

　　江流湾，宫本在戚玉芳的精心照料下，已经痊愈。不明就里的戚玉芳误以为这个姓杨的真是军官，面对宫本的甜言蜜语，戚玉芳邀请宫本陪自己到江北逛庙会。

　　江湖上的骚动引起南京城的混乱，霍然告诉莫采石，蒋委员长对此非常生气，警察厅难辞其咎。关于五九档案的消息众多，一时真假难辨，莫采石赶忙进入卧室查看自己放在保险柜里的五九档案。

　　欧阳倩看到程慈航一身杀气直奔江流湾而去，她要不惜一切代价阻止程慈航抓到马太太，她赶到江边把马太太从半路截了下来。马太太决定从陆路进入戚家庄和戚成祖汇合。戚成祖亲自到码头迎接马太太，他看到程慈航领着一干警察对旅客进行搜查。程慈航发现戚成祖形迹可疑，让手下上前盘问。戚成祖谎称自己是江东村的王勇，对江东村情况很熟悉的警察让戚成祖到警察厅证明身份，锦线弟子刘三掩护戚成祖逃跑时被抓。这时，欧阳倩和关天平(司源 饰)赶来支援程慈航，程慈航让欧阳倩帮助自己查找锦线的秘密基地，他告诉欧阳倩，要把锦线所有成员抓捕归案。不明白程慈航良苦用心的欧阳倩谴责他忘恩负义，程慈航只好把自己真实的目的告诉欧阳倩。

　　得到五九档案赝品的哈金斯被江湖人士骚扰得没有办法，他要求莫采石代表中国政府官方召开新闻发布会澄清真相。